Paziņojuma identifikators
1079c58d-3eb5-4553-bac7-13735bcaccf9
Procedūras juridiskais pamats
Publisko iepirkumu likuma zemsliekšņa procedūra
Paziņojuma tips
Paziņojums par līguma slēgšanas tiesību piešķiršanu
Procedūras identifikators
da65e0d1-3eff-41bb-ad38-072a93ffc0dd
Paziņojuma oficiālā valoda
latviešu valoda
Tiešās piešķiršanas pamatojums
būvdarbus/preces/pakalpojumus var nodrošināt tikai konkrēts piegādātājs ar izņēmuma tiesību aizsardzību saistītu iemeslu dēļ
Tiešās piešķiršanas pamatojuma skaidrojums
Saskaņā ar Publisko iepirkumu likuma 8. panta septītās daļas 2. punkta b) apakšpunktu, pasūtītājs ir tiesīgs piemērot sarunu procedūru ar konkrētu piegādātāju, ja, cita starpā, pakalpojumus var nodrošināt tikai konkrēts piegādātājs konkurences trūkuma dēļ.
Pasūtītāja laboratorijas Molekulārās tipēšanas daļas vajadzībām nepieciešama augstas precizitātes garo lasījumu sekvenēšanas platforma, kas nodrošina pilna garuma HLA gēnu, strukturālo variantu un citu kompleksu genomisko reģionu analīzi ar maksimāli augstu precizitāti, haplotipu fāzēšanu un minimālu interpretācijas nenoteiktību. Izvērtējot tirgū pieejamās tehnoloģijas, par tehniski un funkcionāli piemērotāko risinājumu atzīstama PacBio Vega sistēma.
PacBio Vega platformas būtiskākā priekšrocība ir PacBio HiFi long-read tehnoloģija, kas nodrošina >99,9% sekvenēšanas precizitāti, vienlaikus saglabājot garus lasījumus (~10–20 kb un vairāk), kas ir kritiski svarīgi HLA tipēšanā, transplantoloģijā, imūnģenētikā un citu kompleksu genomisko reģionu analīzē. PacBio tehnoloģija ļauj iegūt pilnībā fāzētus pilna garuma HLA gēnu datus bez nepieciešamības rekonstruēt haplotipus no īsajiem lasījumiem.
Salīdzinot ar Oxford Nanopore Technologies (ONT) risinājumiem (piemēram, PromethION vai GridION), PacBio HiFi tehnoloģijai ir būtiski augstāka natīvā datu precizitāte un zemāks kļūdu īpatsvars kompleksos reģionos. Lai gan ONT platformas nodrošina ļoti garus lasījumus un augstu caurlaidību, literatūrā un ražotāju tehniskajos datos norādīts, ka PacBio HiFi dati ir piemērotāki klīniskai un augstas precizitātes genomiskai analīzei, kur nepieciešama uzticama SNV, strukturālo variantu un HLA aleļu noteikšana.
PacBio tehnoloģijas priekšrocības HLA tipēšanā un imūnģenētikā ir apstiprinātas arī publikācijās un starptautiskajā praksē, kur norādīts, ka pilna garuma long-read sekvenēšana būtiski uzlabo HLA tipēšanas precizitāti un ambiguīšu atrisināšanu salīdzinājumā ar īso lasījumu tehnoloģijām. PacBio SMRT sekvenēšana tiek izmantota augstas izšķirtspējas HLA tipēšanā un IMGT/HLA datubāzes pilnveidē.
Papildus tam PacBio Vega sistēma ir īpaši piemērota laboratorijām ar vidēju paraugu plūsmu, jo:
- nodrošina līdz 60 Gb datu vienā skrējienā;
- neprasa lielu paraugu batch apjomu;
- ļauj veikt sekvenēšanu laboratorijā uz vietas bez ārpakalpojumiem;
- ir kompakta “benchtop” sistēma ar integrētu datu apstrādi un vienkāršotu darbplūsmu;
- nodrošina iespēju nākotnē paplašināt pielietojumu reto slimību, farmakogenomikas un strukturālo variantu analīzē.
Izvērtējot citu ražotāju piedāvājumus:
• Illumina īso lasījumu platformas nenodrošina pilnvērtīgu pilna garuma HLA haplotipu fāzēšanu un sarežģītu strukturālo variantu analīzi;
• Oxford Nanopore platformām ir zemāka bāzes precizitāte un augstāka kļūdu iespējamība klīniski nozīmīgu variantu noteikšanā;
• citas long-read platformas šobrīd nenodrošina PacBio HiFi tehnoloģijai līdzvērtīgu kombināciju starp lasījumu garumu un validētu augstas precizitātes datu kvalitāti.
Ņemot vērā iepriekš minēto, PacBio Vega sistēma ir uzskatāma par tehnoloģiski unikālu risinājumu, kas vispilnīgāk atbilst RAKUS Molekulārās tipēšanas daļas vajadzībām augstas precizitātes long-read sekvenēšanas nodrošināšanai un tirgū nav pieejami citi ekvivalenti risinājumi, tādēļ ir pamatota sarunu procedūras organizēšana konkrētās platformas iegādei. Latvijas teritorijā ierīcei ir tikai viens autorizētais izplatītājs – SIA DIAMEDICA.
Ņemot vērā iepriekš minēto, iepirkums tiek veikts kā sarunu procedūra saskaņā ar 8. panta septīto daļu, kas paredz iepriekšēja paziņojuma par līgumu nepublicēšanu Iepirkumu uzraudzības biroja (turpmāk - IUB) mājas lapā.
Iepirkuma komisija un eksperts izskata sarunu procedūras nolikumu un vienojas, ka nolikums ir atbilstošs pasūtītāja vajadzībām.